Биологический факультет СПбГУ

биофак СПбГУ


Ахмадеева Елена Ринатовна

Квалификационная работа магистра: "Анализ специфичности группы антител класса IgG по данным высокопроизводительного секвенирования библиотек генов."

Аннотация:  На сегодняшний день, антитела составляют приблизительно одну треть от общего количества белков, используемых в терапии различных заболеваний в развитых странах. С их помощью можно проводить качественное и количественное определение содержания различных веществ методами иммуноферментного анализа и многих других. В настоящее время существуют эффективные методы получения рекомбинантных моноклональных антител к перспективным мишеням. Для создания   антител к таким мишеням, необходимо индивидуально исследовать тот или иной способ их получения, а также отработать условия отбора наиболее аффинных представителей. В связи с быстрым развитием   технологии секвенирования нового поколения и применения этой технологии при скрининге моноклональных антител, необходимо изучить способы обработки массива информации, полученного при секвенировании, для того что бы стали возможны новые пути скрининга высокоаффинных антител, которые в перспективе сократят количество in vitro экспериментов. Это позволит более эффективно находить новые биологические маркеры рака, аутоиммунных и многих других заболеваний.
 В связи с актуальностью данной области исследования была определена цель представленной работы: увеличить эффективность процесса поиска моноклональных антител к перспективным мишеням (отбор моноклональных антител из библиотеки без   in vitro экспериментов, основываясь на данных in silico анализа).
Для достижения поставленной цели были решены следующие задачи:
1)    Создана библиотека фрагментов антител к определенному антигену;
2)    Проведено высокопроизводительное секвенирование библиотек генов антител к антигену;
3)    Разработан алгоритм обработки данных секвенирования библиотеки фрагментов антител;
4)    Выбраны кандидаты аминокислотных последовательностей фрагментов антител на основе in silico анализа;
5)    Созданы генетические конструкции scFv фрагментов антител против антигена для экспрессии в E. coli BL21 Gold;
6)    Проведен иммунноферментный анализ фрагментов антител.
В результате данной работы был проведен скрининг in silico моноклональных антител библиотеки и полученные результаты были проверены in vitro.


Направление: Биология

Кафедра: Биохимии

Научный руководитель:  к.б.н. Карабельский А.В., к.б.н. Леонова Л.Е

Отзыв научного руководителя


Рецензент: к.б.н. Тищенко Л.И.

Рецензия

Дата защиты: 15-06-2015



© Биологический факультет СПбГУ, 2006-2011