АБИТУРИЕНТУ   СТУДЕНТУ   ВЫПУСКНИКУ   СОТРУДНИКУ   РАСПИСАНИЯ


БИОЛОГИЧЕСКИЙ ФАКУЛЬТЕТ

ГЛАВНАЯ
НАШ ФАКУЛЬТЕТ
ПОСТУПЛЕНИЕ
ПЕРЕВОД И ВОССТАНОВЛЕНИЕ
ОБРАЗОВАНИЕ
Учебно-методическая комиссия
Бакалавриат
Магистратура
Аннотации элективных дисциплин
Аспирантура
Докторантура
Выпускникам 2017
Конкурсы и стипендии
Соц. пакет студента
Вопросы по справкам и документам
НАУКА
ЭТИЧЕСКИЙ КОМИТЕТ
ШКОЛЬНИКАМ И УЧИТЕЛЯМ
СТУДСОВЕТ
БИБЛИОТЕКА
ЭКСПЕРТНАЯ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ
САЧОК
БЛОГ
ТРУДОУСТРОЙСТВО
АДМИНИСТРАЦИЯ
СВЕДЕНИЯ О СПбГУ
ЗЕЛЕНЫЙ КАМПУС

Авторизация
Запомнить меня на этом компьютере
  Забыли свой пароль?
 

Главная / Образование / Магистратура

Магистерские дипломы




Маретина Марианна Александровна

Квалификационная работа магистра: "Изучение копийности и характера метилирования генов, вовлеченных в патогенез спинальной мышечной атрофии"

Аннотация: Спинальная мышечная атрофия (СМА) - аутосомно-рецессивное нейродегенеративное заболевание, возникающее из-за потери функции мотонейронов передних рогов спинного мозга вследствие мутаций в гене SMN1. Способность гена SMN2 производить 10% полноразмерных транскриптов делает его основным геном-модификатором заболевания. В зависимости от тяжести и времени появления симптомов различают 4 типа СМА: самая тяжелая форма I развивается в младенчестве; самая легкая - IV форма - возникает во взрослом возрасте. Число копий гена SMN2 коррелирует с тяжестью СМА, поэтому определение количества копий гена SMN2 является важным дополнительным критерием при определении типа заболевания. Однако случаи семей, в которых сибсы имеют равное число копий гена SMN2, но разное фенотипическое проявление заболевания, указывают на существование дополнительных факторов, влияющих на тяжесть развития СМА. Одним из таких факторов является метилирование ДНК. Ранее в результате полногеномного анализа метилирования у пациентов со СМА в сравнении со здоровыми людьми были обнаружены значимые различия в уровне метилирования CpG сайтов в 40 генах. Среди этих генов были выбраны те, для которых наиболее вероятна связь с патогенезом СМА - гены DYNC1H1, SLC23A2 и CDK2AP1, к функциям продуктов которых относятся участие в аксональном транспорте, нейритогенезе и ремоделировании хроматина. Для определения уровня метилирования CpG островков была разработана методика анализа кривой плавления ДНК, обработанной бисульфитом натрия. Был проведен анализ кривых плавления продуктов амплификации исследуемых участков генов у 78 образцов ДНК пациентов, среди них 40 c тяжелой (I) и 38 с легкой (III-IV) формой СМА. Для количественной оценки уровня метилирования была проведена полиномиальная интерполяция с использованием данных о плавлении контрольных образцов ДНК с известной степенью метилирования. В результате анализа не было обнаружено значимых различий в уровне метилирования 5’-UTR областей генов SLC23A2 и CDK2AP1 и 41 экзона гена DYNC1H1 между группами пациентов с легкой и тяжелой формой СМА. При этом уровень метилирования 37 экзона гена DYNC1H1 у пациентов с легкой формой СМА оказался значимо выше по сравнению с пациентами с тяжелой формой. Ранее было показано, что метилирование кодирующих последовательностей необходимо для нормальной экспрессии генов; также были описаны мутации в гене DYNC1H1, приводящие к нервно-мышечным заболеваниям в результате нарушения аксоногенеза. Определение числа копий гена SMN2 было проведено у 158 пациентов со СMA I (46), II (80) и III (32) типа с помощью метода ПЦР в реальном времени. У большинства пациентов со СМА I типа было обнаружено 2 копии гена SMN2 (78,26%), у 19,57% - 3 копии гена SMN2, только у одного (2,17%) была обнаружена 1 копия гена SMN2. Большинство пациентов со СМА II типа имеют 3 копии гена SMN2 (76,25%), 13,75% пациентов – 4 копии гена SMN2 и 10% – 2 копии гена SMN2. У 56,25% пациентов с III типом СМА было найдено 4 копии гена SMN2, у 40,63% пациентов - 3 копии гена SMN2 и только у одного (3,12%) - 2 копии гена SMN2. Были получены значимые различия в частотах встречаемости 2, 3 и 4 копий гена SMN2 у пациентов с разными типами СМА. Следовательно, при наличии 2 копий гена SMN2 наиболее вероятно развитие СМА I типа, при наличии 3 копий - СМА II типа, а при 4 копиях гена SMN2 - развитие СМА III типа. Таким образом, число копий гена SMN2 следует учитывать при раннем прогнозе развития заболевания.

Направление: Биология

Кафедра: Генетики и Селекции

Научный руководитель: к. б н. с.н.с Голубкова Е.В., консультант к.б.н. с.н.с Киселев А.В.

Дата защиты: 3-06-2014

Отзыв о магистранте:

Текст (.pdf)

Рецензент: к.б.н. А,В.Киселев

Рецензия:

Текст (.pdf)

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2011г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2012г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2013г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2014г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2015г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2016г.


контакты       карта сайта      почтовый сервер       управление      поддержка

199034, Санкт-Петербург, Университетская наб., 7-9
© Санкт-Петербургский государственный университет, 2006-2017