АБИТУРИЕНТУ   СТУДЕНТУ   ВЫПУСКНИКУ   СОТРУДНИКУ   РАСПИСАНИЯ


БИОЛОГИЧЕСКИЙ ФАКУЛЬТЕТ

ГЛАВНАЯ
НАШ ФАКУЛЬТЕТ
ПОСТУПЛЕНИЕ
ПЕРЕВОД И ВОССТАНОВЛЕНИЕ
ОБРАЗОВАНИЕ
Учебно-методическая комиссия
Бакалавриат
Магистратура
Аннотации элективных дисциплин
Аспирантура
Докторантура
Выпускникам 2017
Конкурсы и стипендии
Соц. пакет студента
Вопросы по справкам и документам
НАУКА
ЭТИЧЕСКИЙ КОМИТЕТ
ШКОЛЬНИКАМ И УЧИТЕЛЯМ
СТУДСОВЕТ
БИБЛИОТЕКА
ЭКСПЕРТНАЯ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ
САЧОК
БЛОГ
ТРУДОУСТРОЙСТВО
АДМИНИСТРАЦИЯ
СВЕДЕНИЯ О СПбГУ
ЗЕЛЕНЫЙ КАМПУС

Авторизация
Запомнить меня на этом компьютере
  Забыли свой пароль?
 

Главная / Образование / Магистратура

Магистерские дипломы




Котова Анастасия Викторовна

Квалификационная работа магистра: "Кариологический и молекулярно-филогенетический анализ рода Aurelia (Cnidaria, Scyphozoa)"

Аннотация: Кишечнополостные — одна из наиболее древних групп низших многоклеточных. Её представители характеризуются высокой степенью морфологической пластичности, разнообразием жизненных циклов, широким ареалом и представляют интерес для эволюционных биологов, экологов и биологов развития. Род Aurelia, относящийся к семейству Ulmaridae, отряду Semaeostomeae, классу Scyphozoa, долгое время считался видом-космополитом Aurelia aurita, обладающим самым большим ареалом из всех Scyphozoa . Из-за высокой степени морфологической изменчивости на протяжении двадцатого века исследователи выделяли разное количество видов. С появлением молекулярных методов анализа филогенетических отношений изучение взаимоотношений внутри рода Aurelia, основанное на сравнении последовательностей ядерных рибосомальных генов, митохондриальных 16S и генов субъединицы I цитохром с — оксидазы, привело к пересмотру его таксономии. Исследователи выявили неоднородность вида Aurelia aurita. Оказалось, что географически отдаленные популяции медуз, относимые к виду Aurelia aurita, существенно отличаются друг от друга согласно молекулярному анализу. Так, например, медузы из Белого и Черного моря составляют единую группу и относятся к виду Aurelia aurita, в то время как медузы из Японского моря относятся к отдельной группе, обозначенной в исследованиях A. sp.1. Цель настоящей работы заключалась в проведении филогенетического анализа представителей трех географически изолированных популяций рода Aurelia (т. Cnidaria) на основании последовательностей генов 18S и 28S рРНК, кариотипов и выявления мезоглеин-подобных белков. Впервые секвенированы последовательности рибосомных генов 18S и 28S рРНК и описан кариотип медуз Aurelia из Черного моря. Все полученные сведения о кариотипах, последовательностях рибосомных генов и результатах сравнения медуз с использованием мезоглеина, как дополнительного маркера, согласуются с проведёнными ранее исследованиями, и позволяют сделать вывод, что медузы из Черного и Белого морей представляют собой вид Aurelia aurita, а медузы из Японского моря формируют криптовид Aurelia sp.1.

Направление: Биология

Кафедра: Цитологии и Гистологии

Научный руководитель: д.б.н. Подгорная О.И.

Дата защиты: 10-06-2014

Отзыв о магистранте: Настя Котова пришла в нашу лабораторию в конце третьего курса бакалавриата. С самого начала своей работы в лаборатории Настя проявила увлеченность и заинтересованность в освоении новых методов и в самостоятельном планировнии экспериментальной работы. По мере погружения в работу Настя достаточно легко освоила различные гистологические, микроскопические и молекулярно-биологические методы, результаты которых представлены в выпускной квалификационной работе после бакалавриата. За один год Насте удалось не только освоить новые для нее методы, но и получить новые достоверные результаты. Настя успешно работает в экспедиционных условиях, являясь зачастую просто незаменимым участником рабочего процесса. Работа с беспозвоночным объектом, особенно с сезонным, имеет свои особенности и трудности, и не каждый исследователь готов с этим мириться. Такая работа требует особенной увлеченности и самоотдачи, и в течении морских полевых сезонов (3) Настя проявила эти качества. Результаты проделанной Котовой А.В. работы в тезисах конференций. После защиты магистерского диплома Настя будет поступать в Аспирантуру Санкт-Петербургского государственного университета и, надеюсь, продолжит работу в настоящем исследовании. По материалам магистерского диплома будет подготовлена к публикации статья. Настя дружелюбена, общительна, способствует созданию хорошей рабочей атмосферы в группе, она легко налаживает контакты с коллегами.

Рецензент: А.В. Родионов

Рецензия: Цель работы представляется мне более чем актуальной: до сих пор о кариотипах медуз известно очень мало, а что касается результатов молекулярно-филогенетических исследований, то они строятся на основании ITS-последовательностей и генов COI. При этом, например, последовательности ITS1 Aurelia sp. 2, опубликованные Dawson M.N. and Jacobs D.K. «Molecular evidence for cryptic species of Aurelia aurita (Cnidaria, Scyphozoa)» - Biol. Bull. 200 (1), 92-96 (2001) отличаются от ITS1 других образцов Aurelia на 54,5%. Эксперимента ради, я, с помощью таблицы случайных чисел, сформировал произвольную последовательность из 230 нуклеотидов и сравнил с ITS1 видов Aurelia, имеющимися в GENBANK –моя искусственная последовательность отличалась от ITS Aurelia на 55-60% - результат, как видите, сопоставимый. А вывод из этого эксперимента: в молекулярной филогении медуз еще есть что делать. Даже если отмести крайние варианты, то, как отмечает в тексте диссертации Анастасия Викторовна Котова, при попарном сравнении последовательностей ITSI из геномов Aurelia aurita из разных точек ареала различия составляют от 10% до 40%, при этом длина ITSI варьирует от 240 до 360 нуклеотидов. Такие различия в длинах означают высокую частоту инделей, что всегда затрудняет поиск гомологичных нуклеотидов при выравнивание последовательностей и делает измеренные после выравнивания генетические расстояния между сравниваемыми последовательностями малодостоверными. Иными словами, степень изменчивости и COI, и, особенно, ITS1-последовательностей Aurelia слишком большая, чтобы анализируя их можно было бы делать достоверные выводы о родственных отношениях разных природно-географических рас медуз, традиционно относимых к этому роду. Эту задачу можно решить только анализируя эволюционно консервативные последовательности, такие как гены 18S и 28S рРНК, что и было сделано в данной работе. Как выпускная квалификационная работа магистранта, защищаемая сегодня работа заслуживает самой высокой оценки. При чтении ее видно, что Анастасия Викторовна Котова получила хорошее общебиологическое образование о овладела многими методами современной клеточной биологии, такими как классические методы цитологии и гистологии, как методы работы с ДНК и белками, методы клонирования, методы иммуноблотинга, наконец, методы цитогенетического анализа. Полученные ею результаты интересны и несомненно послужат дальнейшему прогрессу в понимании биоразнообразия медуз. Это не значит, что в работе нет недостатков. Основной из них состоит в том, что половина работы посвящена сравнительному анализу последовательностей генов 18S и 28S рРНК, и, как я уже сказал выше, эта часть работы имеет, или должна иметь, очень большое значение для всей современной науки о медузах. Однако диссертант оставляет читателя в неведенье, какой именно участок 18S и 28S рДНК был секвенирован и взят в анализ. Уж точно, не весь ген – во всяком случае, 28S рРНК – очень длинная работа. Из текста работы не видно, какие были генетические расстояния между последовательностями. Были ли там синапоморфные замены, характерных для отдельных географических рас? Еще одно замечание касается способа ссылок – автор иногда пишет фамилии авторов работ с инициалами, иногда нет, иногда, на английский манер, если в статье 2 автора, то их фамилии объединены союзом and или знаком &, в других случаях, ставится только запятая. Частное замечание (вопрос): на стр 13 диссертант пишет : «Диплоидное число хромосом составляет 22, число хромосомных плеч — 88.» - Вопрос – Сколько плеч у 1 линейной хромосомы эукариот? Мне кажется, у хромосомы 2 плеча - p- короткое и q-длинное. Отмеченные досадны, однако не настолько значительны, чтобы оценить работу оценкой ниже чем «ОТЛИЧНО».

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2011г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2012г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2013г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2014г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2015г.

Аннотации квалификационных работ магистров выпуска 2016г.


контакты       карта сайта      почтовый сервер       управление      поддержка

199034, Санкт-Петербург, Университетская наб., 7-9
© Санкт-Петербургский государственный университет, 2006-2017