Биологический факультет СПбГУ

биофак СПбГУ


Кондрашкина Александра Михайловна

Квалификационная работа магистра: "Получение плюрипотентных стволовых клеток для генной терапии иммунодефицита у мышей на основе искусственных хромосом."

Аннотация:   Сцепленный с X хромосомой врожденный комбинированный иммунодефицит (X-SCID) – генетическое заболевание, обусловленное мутацией в гене IL2RG, продуктом которого является гамма цепь рецептора к IL2. В настоящее время наиболее  перспективной терапией X-SCID представляется генотерапия с использованием искусственных хромосом человека (ИХЧ). Рекомбинантные конструкции ИХЧ вносят в геном индуцированных плюрипотентных стволовых (иПС) клеток, полученных путем репрограммирования фибробластов пациента. В нашей лаборатории ранее была сконструирована ИХЧ, несущая ген IL2RG. Данная диссертация посвящена получению иПС клеток мышей, мутантных по гену гамма цепи рецептора к IL2, а также характеристике терапевтической искусственной хромосомы, содержащей последовательность гена IL2RG.
В рамках работы мы получили индуцированные плюрипотентные стволовые клетки мышей, мутантных по гену IL2RG. Репрограммирование первичных фибробластов осуществлялось с помощью лентивирусной системы экспрессии генов, кодирующих факторы Oct4, Sox2, Klf4 и c-Myc. Для подтверждения плюрипотентной природы полученых клеток, мы показали наличие экспрессии эндогенного OCT4, путем иммуноцитохимического окрашивания на данный маркер. Далее мы провели тест на формирование тератом в иммунодефицитных NU/J мышах, в результате которого достоверно показали присутствие производных двух зародышевых листков, что в совокупности является доказательством плюрипотентных свойств IL2RG-/- иПС клеток мыши.
Мы показали независимое положение ИХЧ и наличие генетической конструкции IL2RG в линии CHO клеток с помощью флуоресцентной гибридизации in situ. CHO клетки в дальнейшем будут использованы в роли донорных для передачи искусственной хромосомы в IL2RG-/- иПС клетки реципиенты, результатом чего станет создание индуцированных плюрипотентных стволовых клеток для терапии иммунодефицита в модельной системе мыши.

Направление: Биология

Кафедра: Генетики и Биотехнологии

Научный руководитель:  к.б.н. Голубкова Е.В.

Отзыв научного руководителя
Кондрашкина Александра Михайловна начала работу в лаборатории молекулярной биологии стволовых клеток в 2013 г., будучи студенткой 1-го курса магистратуры. Со 2-го курса бакалавриата Александра Михайловна проводила исследовательскую работу в лаборатории физиологической генетики СПбФ ИОГен РАН. Научная работа Александры Михайловны посвящена получению индуцированных плюрипотентных стволовых клеток, и анализа активности целевых искусственных хромосом человека для модельной системы тканезаместительной генотерапии X-SCID-иммунодефицита у мыши. Данная работа обладает существенной значимостью, так как разработка подходов тканезаместительной терапии с применением индуцированных плюрипотентных стволовых клеток и искусственных хромосом являются одним из наиболее перспективных направлений лечения широкого спектра заболеваний человека. Александра Михайловна обладает целеустремленностью и высокой работоспособностью. Она является первым автором статьи опубликованной в журнале «Молекулярная Биология». А так же, соавтором статьи зарубежного журнала «Current Genetics», двух статей в русских изданиях, рекомендованных ВАК, и шести тезисных сообщений, опубликованных в материалах международных и Всероссийских конференций, что является весьма высоким результатом для студента второго курса магистратуры. Александра Михайловна – победитель конкурса грантов Администрации Санкт-Петербурга для студентов и аспирантов 2012 года и трижды выигрывала повышенную академическую стипендию Санкт-Петербургского государственного университета.
У меня остались весьма хорошие впечатления от исследовательской деятельности А.М. Кондрашкиной. За время выполнения своей дипломной работы она освоила достаточно широкий спектр методов молекулярной биологии, биохимии, и методы культивирования клеток млекопитающих, приобрела навыки самостоятельного написания научных текстов и заявок на гранты. А.М. Кондрашкина обладает целеустремленностью, вдумчивостью, критическим и творческим подходом к поставленным целям и способна проводить большие объемы экспериментальной работы. Знание английского языка и достаточно высокий уровень биологических знаний позволяет ей быть в курсе новейших научных работ и легко осваивать методы современной биологии. Александра Михайловна Кондрашкина активна в обсуждении рабочих вопросов, продуктивно взаимодействует с коллегами, и успешно развивается как молодой ученый, виден значительный прогресс в совершенствовании ее навыков и освоении научных знаний в процессе выполнения данной работы, которая без сомнения заслуживает только отличную оценку.


Рецензент: к.б.н. О.В.Баженова

Рецензия 

Работа посвящена разработке методов генной терапии наследственного иммунодефицита (X-SCID) с использованием искусственных хромосом. Цели и задачи работы четко сформулированы. Работа состоит из общепринятых разделов: введения, обзора литературы, материал и методы, результаты и обсуждение, выводы и списка литературы. Работа представлена на 64 страницах, из которых 26  страниц отведены обзору литературы. В обзоре литературы освещены сведения, непосредственно относящиеся к цели работы, которые включают успехи и тенденции в развитии генной терапии X-SCID, информацию по основным характеристикам индуцированных плюрипотентных стволовых клеток, сигнальным путям, принимающим участие в процессе репрограммирования клеток, использованию индуцированных плюрипотентных стволовых клеток для терапии генетических заболеваний. Обзор написан хорошим научным языком на основе изучения 109 статей, 105 из которых на английском языке. В работе использован широкий спектр современных методов молекулярной генетики, в том числе получение индуцированных плюрипотентных клеток мыши и флуоресцентная гибридизация ДНК in situ. Раздел результатов исследования представлен на 12 страницах.  В нем приведены  доказательства получения индуцированных плюрипотентных  клеток мыши генотипа IL2RG-/- и независимое положения искусственной хромосомы. Работа аккуратно оформлена и почти не содержит опечаток ( кроме титульной страницы и страниц 24, 38, 47, 50).
    К недостаткам следует отнести тот факт, что рисунки 2, 3 и 4 не содержат масштаба увеличения. На странице 39 представлена таблица 1, в которой автор характеризует скорость роста полученных плюрипотентных клонов. Однако, методика оценки данного параметра не описана в разделе “Материалы и методы”. Хотелось бы также улучшить качество иммунофлуоресцентной окраски, в частности, представленной на рисунке 6, где рецензент не смог увидеть зеленого флуоресцентного сигнала.
    В целом - это серьезная  работа, содержащая результаты прикладного значения. Дальнейшее развитие данного направления представляет несомненный интерес в области разработки методов генной терапии человека. Поставленные в работе задачи выполнены и соответствуют сделанным выводам. Работа студентки Кондрашкиной Александры Михайловны на тему:“ Получение плюрипотентных стволовых клеток для генной терапии иммунодефицита у мышей на основе искусственных хромосом” полностью соответствует требованиям выпускнoй квалификационной работы  на степень магистра и заслуживает отличной оценки.


Дата защиты: 17-06-2015






© Биологический факультет СПбГУ, 2006-2011