Беланов Сергей Сергеевич
Квалификационная работа магистра: "Применение молекулярных методов для диагностики пневмококковых инфекций и оценки популяционной структуры пневмококков"
1. Цель работы:
Оценить серотиповый состав популяции пневмококков, вызывающих острый отит и бессимтомное носительство.
2. Задачи:
Оптимизировать условия методики ПЦР-серотипирования пневмококков в клиническом материале; Провести серотипирование пневмококков в чистых культурах и клиническом материале; Провести анализ пневмококковых серотипов составляющих популяцию Санкт-Петербурга и серотипов различных пневмококковых вакцин.
3. Актуальность исследования.
Данные исследования необходимы для обоснования состава пневмококковых вакцин. В популяции Streptococcus pneumoniae найдено более 90 серотипов, при этом практически не исследовано какие именно из них вызывают основные пневмококковые инфекции в России.
4. Материалы и методы.
Микробиологические методы. Выделение тотальной бактериальной ДНК. Амплификация фрагментов генома. ПЦР-серотипирование S. pneumoniae
5. Дизайн исследования.
Экологическое.
6. Краткое изложение основных результатов исследования.
Была исследована выборка из 226 больных острым отитом и носителей. Реакция Пцр-серотипирования была оптимизирована для работы с клиническим материалом. Результаты ПЦР-серотипирования совпадали с результатами классического серотипирования. Наиболее распространенными были серотипы 23F (35,2%) и 19F (13,1%). К серогруппе 6 относились 18,2% изолятов: к серотипу 6B – 9,7%, к 6А – 3,0% (5,5% изолятов 6 серогруппы не были дифференцированы на серотипы). Полученные данные показывают, что 13-валентная вакцина будет перекрывать около 82% популяции пневмококков Санкт-Петербурга и является наиболее эффективной. Для сравнения, 7-ми и 10-ти валентные вакцины охватывают не более 50% популяции.
7. Выводы.
Подобраны и оптимизированы условия для методики ПЦР-серотипирования в клиническом материале. В частности, были подобраны праймеры, с использованием программы Oligo v.6.31, а так же опытным путем было установлено оптимальное количество циклов амплификации и их температурный профиль.
Было проведено серотипирование коллекции чистых культур S.pneumoniae и выборки из 226 детей с острым отитом и бессимтомным носительством. Установлен серотиповый состав данной выборки.
В результате сравнения полученных данных с различными пневмококковыми вакцинами было показано, что 7-ми валентная вакцина охватывает примерно 48% популяции S.pneumoniae, 10-ти валентная примерно столько же. Наиболее эффективной оказывается 13-ти валентная вакцина, перекрывающая около 82% популяции пневмококков Санкт-Петербурга.
Направление: Биология
Специализация «Эпидемиология» магистерской программы «Общественное здоровье».
Дата защиты: 21-06-2011
|
