Кафедра обладает обширной коллекцией гистологических препаратов, насчитывающей около 7000 единиц хранения, собранные А.С.Догелем, проф. Д.И.Дейнекой и позже – проф. Г.А.Невмывакой. Среди них - уникальные препараты представляющие полную картину организации нервной системы дождевого червя, полученные профессором Г.А.Невмывакой в результате многолетних исследований. Помимо этого в коллекцию входят уникальные цитологические препараты, представляющие большой исторический интерес и иллюстрирующие строение органоидов клетки – выявленных на световом уровне аппарата Гольджи, митохондрий и т.д.

Препараты коллекции кафедры иллюстрируют тонкое строение практически всех тканей человека и многих позвоночных животных. С приходом на кафедру проф. А.А.Заварзина коллекция значительно пополнилась препаратами, иллюстрирующими организацию тканей беспозвоночных. Значительная часть препаратов постоянно используется в учебном процессе.  Такие препараты хранятся в специальных шкафах на стеклянных подносах, остальные – в контейнерах, защищенных от пыли и прочих вредных воздействий. единиц хранения. В коллекцию входят препараты, изготовленные еще в начале прошлого века крупнейшими учеными – основателем кафедры