|
Организована – в 1986 году
Члены лаборатории:
Галкина Светлана Анатольевна, к.б.н., научный сотрудник каф. генетики и биотехнологии
|
|
 | |
|
Научная школа «Феномен хромосом типа ламповых щеток: вклад в биологию развития, клеточную биологию и эволюционную цитогенетику» Гранты РФФИ
Направления исследований:
| |
Публикации за последние 3 года:
-
Komissarov A.S., Galkina S.A., Koshel E.I., Kulak M.M., Dyomin A.G., O’Brien S.J., Gaginskaya E.R., Saifitdinova A.F. New high copy tandem repeat in the content of the chicken W chromosome // Chromosoma. 2017 https://doi.org/10.1007/s00412-017-0646-5.
-
Dyomin A., Volodkina V., Koshel E., Galkina S., Saifitdinova A., Gaginskaya E. Evolution of ribosomal internal transcribed spacers in Deuterostomia // Molecular Phylogenetics and Evolution. 2017. P. 87-96. http://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2017.08.015
-
Bellott D.W., Skaletsky H., Cho T-J., Brown L., Locke D., Chen N., Galkina S., Pyntikova T., Koutseva N., Graves T., Kremitzki C., Warren W.C., Clark A.G., Gaginskaya E., Wilson R.K., Page D.C. Avian W and mammalian Y chromosomes convergently retained dosage-sensitive regulators // Nature Genet. 2017. V. 49. P. 387-394. http://doi.org/10.1038/ng.3778.
-
Galkina S., Fillon V., Saifitdinova A., Daks A., Kulak M., Dyomin A., Koshel E., Gaginskaya E. Chicken microchromosomes in the lampbrush phase: a cytogenetic description // Cytogenetic and Genome Research. 2017. V. 152. P.46-54. https://doi.org/10.1159/000475563.
-
Давидьян А., Кошель Е., Лаврова О., Демин А., Галкина С., Сайфитдинова А., Гагинская Е. Функциональные особенности ядрышкового организатора в растущих ооцитах неполовозрелых самок птиц // Онтогенез. 2017. T. 48. № 3. C. 1–8.
-
Dyomin A. G., Danilova M. I., Mwacharo J. M., Masharsky A. E., Panteleev A. V., Druzhkova A.S., Trifonov V. A., Galkina S. A. Mitochondrial DNA D-loop haplogroup contributions to the genetic diversity of East European domestic chickens from Russia // Journal of Animal Breeding and Genetics. 2017. Vol. 134. № 2. P. 98-108. https://doi.org/10.1111/jbg.12248
-
Koshel E., Galkina S., Saifitdinova A., Dyomin A., Deryusheva S., Gaginskaya E. Ribosomal RNA gene functioning in avian oogenesis // Cell and Tissue Research. 2016. V. 366. № 3. P. 533–542. https://doi.org/10.1007/s00441-016-2444-4
-
Dyomin A. G., Koshel E. I., Kiselev A. M., Saifitdinova A. F., Galkina S. A., Fukagawa T., Kostareva A. A., Gaginskaya E. R. Chicken rRNA Gene Cluster Structure // PLoS ONE. 2016. V. 11. № 6e0157464. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0157464
-
Kulikova T., Chervyakova D., Zlotina A., Krasikova A., Gaginskaya E. Giant poly(A)-rich RNP aggregates form at terminal regions of avian lampbrush chromosomes // Chromosoma. 2016. V. 125. № 4. P. 709-724. https://doi.org/10.1007/s00412-015-0563-4
-
Сайфитдинова А.Ф., Галкина С.А., Кошель Е.И., Гагинская Е.Р. Роль повторяющихся последовательностей в эволюции половых хромосом у птиц // Цитология. 2016. T. 5. № 8 (5). С. 393–398.
-
Галкина С.А., Демин А. Г., Пантелеев А. В., Дружкова А.С, Трифонов В.А., Григорьева Н.В. Перспективы и методика анализа ДНК ископаемых костей домашней курицы, обнаруженных при археологических раскопках // Ладога и проблемы средневековой истории северной Евразии. 2016. С. 118-124.
-
Stepakov A., Galkina S., Bogomaz D., Gaginskaya E., Saifitdinova A. Modified synthesis of 6-carboxyfluorescein (6-FAM): application to probe labelling for conventional cytogenetics // British Journal of Applied Science and Technology. 2015. V. 7. № 4. P. 423-428. https://doi.org/10.9734/BJAST/2015/15991
Ученые СПбГУ обнаружили новый тандемный повтор в геноме курицы
Ключевой элемент генома курицы — расшифрован
Ученые установили, как и когда курицы попали на север Европы
Alumni
Василевская Елена Владимировна, ВКР бакалавра (2008)
Вишнякова Наталья Михайловна, аспирант (1995-1998)
Дакс Александра Александровна, ВКР бакалавра (2008), магистерская диссертация (2011)
Данилова Мария Игоревна, ВКР бакалавра (2015)
Дедух Дмитрий Викторович, магистерская диссертация (2012), кандидатская (2016)
Дерюшева Светлана Ефимовна, к.б.н., старший научный сотрудник (2000-2009)
Дёмин Александр Геннадьевич, к.б.н., постдок (2014-2016)
Евтеев Андрей Владимирович, магистерская диссертация (1998)
Жаркова Людмила Васильевна, лаборант (1975-2014)
Журов Владимир Геннадьевич, ВКР бакалавра (1997)
Захарова Ксения Вениаминовна, ВКР бакалавра (2003)
Злотина Анна Михайловна, ВКР бакалавра (2007), магистерская диссертация (2009), кандидатская диссертация (2012)
Калинина Елена Ивановна, кандидатская диссертация (1987)
Красикова Алла Валерьевна, магистерская диссертация (2003), кандидатская диссертация (2007)
Кропотова Екатерина Витальевна, кандидатская диссертация (1984)
Куликова Татьяна Вадимовна, магистерская диссертация (2004)
Курганова Анна Геннадьевна, ВКР бакалавра (2004), магистерская диссертация (2006)
Лукина Наталья Александровна, к.б.н., научный сотрудник (1985-2014)
Лянгузов Иван Андреевич, магистерская диссертация (2001)
Маслова Антонина Владимировна, стажер-исследователь (2008-2014)
Мальченков Юрий Леонидович, инженер-электроник (1975-1997)
Пастухова Валентина Ивановна, инженер, (1974-2015)
Пичугин Андрей Михайлович, магистерская диссертация, (2004)
Попова Дарья Александровна, магистерская диссертация (2013)
Родионов Александр Викентьевич, д.б.н., старший научный сотрудник, 1984-2002 докторская диссертация (2001)
Соловей Ирина Валерьевна, к.б.н., старший научный сотрудник, 1987-1996
Стрельцова Елена Валентиновна, дипломная работа(1988)
Ткачева (Журова) Евгения Владимировна, дипломная работа 1994
Тимофеев Кирилл Викторович, к.ф.-м.н., инженер, 1999-2007
Тимофеева (Едалина) Людмила Петровна, дипломная работа (1976)
Ходюченко Татьяна Александровна, магистерская диссертация (2009), кандидатская диссертация (2013)
Хутинаева Марина Александровна, кандидатская диссертация (1990)
Цветков Александр Геннадьевич, кандидатская диссертация (1987)
Челышева Людмила Анатольевна, кандидатская диссертация (1990)
Чечик Мария Самуиловна, дипломная работа (1995)
Чинь Суан Хау, кандидатская диссертация (1977)
Основные научные результаты коллектива лаборатории:
1. Птицы обладают своеобразным типом оогенеза, промежуточным между гетеротрофным и автотрофным (хромосомы преобразуются в типичные ламповые щетки, но амплификация рибосомных генов не происходит и ядрышковый организатор в растущих ооцитах у взрослых птиц инактивирован). – Цитология, 1969, 1972, 1975.
2. Разработка метода выделения гигантских хромосом типа ламповых щеток из растущих ооцитов птиц и введение нового экспериментального объекта в цитогенетику, клеточную биологию и биологию развития. - Цитология, 1984; J.Cell Science, 1992, 1995; Chromosome Research, 1994, 1996; Cytogenet Genome Res, 2009; Chromosome Research 2012; Biological Communications, 2017.
3. Сравнительная характеристика функциональной морфологии ядра ооцита у половозрелых и неполовозрелых самок птиц. – Онтогенез, 1979, 1980; Цитология, 1980; Cell and Tissue Research, 2016; Онтогенез, 2017.
4. Выявление и детальное описание процесса амплификации рибосомных генов в ооцитах представителей иглокожих (морская звезда Henricia sp.) с применением метода гибридизации нуклеиновых кислот in situ. До этого считалось, что в оогенезе иглокожих рибосомные гены не амплифицируются. - Цитология, 1987; Cell Differentiation, 1988.
5. Выявление и выделение сателлитной центромерной ДНК в составе межхромосомных коннектив на препаратах метафазных митотических хромосом. – Цитология, 2000, Молекулярная биология, 2001; Genome, 2001.
6. Открытие новых семейств сателлитных повторов ДНК в геномах птиц и выявление транскрипции сателлитной ДНК на хромосомах типа ламповых щеток. Детальное описание ко-транскрипционных этапов процессинга продуктов транскрипции субтеломерных (Z-макросателлит, РО41, CNM), перицентромерных (PR1, CNM, BglII-повтор) и интерстициальных тандемных повторов некодирующей ДНК. - J.Cell Science, 1995; Chromosome research, 1994, 1996, 2006, 2012; Chromosomа, 2007, 2017; Генетика, 2010; Цитология, 2016.
7. Открытие новой внутриядерной органеллы – центромерного белкового тела, представляющего универсальный маркер центромерных районов мейотических хромосом в фазе ламповых щеток и участвующего в формировании кариосферы на поздних этапах оогенеза. Характеристика ее структуры и макромолекулярного состава. – Цитология, 1969, 1972, 1983, 2010; Chromosome Research, 1996, 2003, 2005, 2006, 2012; Chromosoma, 2004; Cytogenetic and Genome Research, 2010.
8. Построение цитологических карт хромосом стадии ламповых щеток из ооцитов птиц и использование ламповых щеток в качестве перспективной модели для картирования последовательностей ДНК с разрешением, в 30 раз превышающим разрешение физического картирования митотических хромосом. – Цитология, 1988, 1989, 1990; Генетика, 2002, 2010; J. Cell Sci., 1992; Chromosome Research, 1994, 2001, 2005, 2006, 2012; Journal of Heredity, 2002; Cytogenetic and Genome Research, 2005, 2010, 2017; Genetica, 2006; BMC Genomics, 2008, 2010; Nature Genetics, 2017.
9. Детальное описание половых хромосом птиц отрядов Galliformes, Columbiformes, Passeriformes. – Цитология, 1990; Chromosome research, 1993, 1998; Chromosoma, 2017.
10. Схема эволюции блочной организации хромосом, определение времени возникновения и характеристика анцестрального кариотипа у птиц. Сравнительный анализ блочной организации митотических хромосом и хромомеро-петлевой организации хромосом типа ламповых щеток в кариотипах. - Цитология, 1984,1989; Генетика, 1985, 1996, 1998; Chromosome Research, 2001; 2005; Cytogenetic and Genome Research, 2005.
11. Низкая частота межхромосомных перестроек в эволюции птиц отрядов Passeriformes, Columbiformes, Galliformes. – Chromosome Research, 2004, 2012; Genetica, 2006; Chromosoma, 2007; BMC Genomics, 2008; Cytogenetic and Genome Research, 2009.
12. Идентификация макрохромосом и микрохромосом в стадии ламповых щеток из ооцитов домашней курицы с использованием метода «хромосомный пэйнтинг» (FISH с зондами индивидуальных хромосом). – Chromosome Research, 2003, 2006, 2012; BMC Genomics, 2010; Cytogenetic and Genome Research, 2017.
13. Определение минимального размера микрохромосом в кариотипе домашней курицы. – Генетика, 2001.
14. Доказательство с помощью хромосом типа ламповых щеток того, что подавляющее большинство микрохромосом в кариотипе перепела, в отличие от микрохромосом курицы, - субметацентрические, в них короткое плечо образовано полиморфным блоком гетерохроматина, транскрипционно активным на стадии ламповых щеток. - Chromosome Research, 2006, 2012; Cytogenetic and Genome Research, 2009.
15. Распределение хиазм в мейотических хромосомах домашней курицы, выявление горячих точек рекомбинации и составление карт событий кроссинговера у домашней курицы на модели хромосом типа ламповых щеток. - Генетика, 1992, 2006; Journal of Heredity, 2002; Chromosome Research, 2005; 2012.
16. Отсутствие перицентрических инверсий в хромосомах 1, 3-5, 12-15, 27 домашней курицы и японского перепела. Наличие перицентрических инверсий в хромосомах 2 и 11 домашней курицы и японского перепела. Доказательство того, что центромеры в хромосомах 1, 3, 4 в ходе эволюции птиц отряда Galliformes формировались de novo. - Genetica, 2006; 2012.
17. Заполнение брешей в расшифрованных последовательностях хромосом в международном проекте Chicken Genome Project (www.ncbi.nih.gov). - Chromosome Research, 2006; Cytogenetic and Genome Research, 2010; Генетика, 2010; BMC Genomics, 2010; PLOS ONE, 2016; Nature Genetics, 2017.
18. Расшифрована последовательность кластера рРНК генов в геноме домашней курицы. Проведен анализ эволюции внутренних транкрибируемых спейсеров (ITS) у Deuterostomia, выявлено постепенное накопление ГЦ-нуклеотидов в их составе (PLOS One, 2016; Molecular Phylogenetics and Evolution, 2017).