В настоящее время научные исследования сотрудников, аспирантов и студентов кафедры охватывают широкий спектр фундаментальных биологических проблем. Важнейшими среди них являются следующие направления:

• Систематика и филогения насекомых (руководитель – профессор, д.б.н. Н.Ю.Клюге);

• Сравнительная и функциональная морфология насекомых (руководители – профессор, д.б.н. Н.Ю.Клюге, доцент, к.б.н. В.Д.Иванов);

• Молекулярная систематика и филогенетика (руководители – д.б.н., в.н.с. В.А.Лухтанов; с.н.с. М.С.Вишневская);

• Механизмы видообразования и эволюции биологического разнообразия (руководитель – д.б.н., в.н.с. В.А.Лухтанов; с.н.с. М.С.Вишневская);

• Эволюционная и физиологическая экология наземных членистоногих (руководитель – доцент, к.б.н. Е.Б.Лопатина);

• Иммунология и биофармакология насекомых (руководитель – к.б.н., н.с. А.Ю.Яковлев).