Кафедра микробиологии СПбГУ - единственный на Северо-западе Российской Федерации центр подготовки специалистов, владеющих наиболее полным набором теоретических и практических компетенций в области классической и современной микробиологии. На Кафедре ежегодно в среднем обучаются 12 студентов двух курсов бакалавриата и 15 студентов двух курсов магистратуры, а также 3 аспиранта.

В рамках учебного плана Кафедра реализует 3 общих курса, 27 спецкурсов и 11 практикумов. 

В основе учебно-научного процесса на Кафедре лежат авторские курсы лекций и практические занятия. Учебными пособиями служат оригинальные учебники и монографии.