Кафедра микробиологии, которую с 2000 г. по настоящее время возглавляет ученик Б.В.Громова, заслуженный работник высшей школы Российской федерации профессор А.В.Пиневич - это единственный на северо-западе Российской Федерации научно-образовательный центр,  в котором осуществляется профессиональное обучение в области фундаментальной микробиологии и вирусологии по университетским программам бакалавриата, магистратуры и аспирантуры.

В сфере научных интересов кафедры находятся три группы микроскопических живых объектов - бактерии, протисты и вирусы из постоянно пополняемого музея живых культур Санкт-Петербургского университета (CALU).

Тематика работ кафедры исключительно широка. Она охватывает разнообразные аспекты цитологии, метаболизма, генетики, регуляции, экологии, филогении и систематики микроорганизмов, а также вопросы их практического применения.

Исследовательские группы, традиционно сложившиеся на кафедре (группа проф. А.В.Пиневича, группа проф. К.В.Квитко и группа проф. Е.В.Ермиловой), решают актуальные научные проблемы, к решению которых привлекаются современные методы экспериментального и теоретического анализа.

Кафедра располагает парком новейшего оборудования для проведения микроскопических, физиолого-биохимических и молекулярно-биологических исследований.

В 2005-2010 гг. на кафедре ежегодно специализируются в среднем по 14 студентов бакалавриата и 6 студентов магистратуры. Выпускные квалификационные работы выполняются на кафедре и в двух ее лабораториях, а также в научных учреждениях-партнерах Санкт-Петербурга.

Научные исследования в рамках Темплана и инициативных научных проектов (за последние пять лет выиграно 24 гранта, из них 13 грантов РФФИ) осуществляются по 18 темам. В 2005-2010 гг. по их результатам выпущено 158 публикаций (47 статей, 104 тезиса конференций, 4 учебника и 3 монографии).

За последние пять лет сотрудники и студенты кафедры приняли участие в 47 конференциях (из них в 33 международных).

В рамках научного партнерства сотрудники и студенты кафедры командируются в ведущие учебно-научные центры Германии, Голландии, Испании, Норвегии, США, Франции, Чехии, Швеции и Японии.