Научные интересы:

Биохимия и генетика дрожжей, генетический контроль экспрессии генов, регуляция метаболизма, экспрессия гетерологичных генов, молекулярная биотехнология.

Читаемые курсы:

• Молекулярная биология (3 курс бакалавриата, для студентов биологического факультета, 6 семестр) 
• Основы молекулярной биологии (1 курс магистратуры, для студентов магистерских программ «Клеточные и генетические технологии» и «Молекулярно-генетические основы агробиотехнологии», 9 семестр)
• Протеомика (1 курс магистратуры, для студентов магистерской программы «Молекулярно-генетические основы агробиотехнологии», 9 семестр)
• Трансляция и посттрансляционная судьба белков совместно с Москаленко С.Е. (2 курс магистратуры, 11 семестр)
• Протеомика (2 курс магистратуры, для студентов магистерской программы «Биоинформатика», 12 семестр)

Избранные публикации:

• Padkina M.V., Sambuk E.V. Genetically Modified Microorganisms as Producers of Biologically Active Compounds // Rus. J. Genet. Appl. Res. 2016. V.6. Is.6. P.669-683. doi: 10.1134/S207905971606006X
• Britvin S.N., Rumyantsev A.M., Zobnina A.E., Padkina M.V. Molecular structure, interatomic interactions and vibrational analysis of 1,4-diazabicyclo[3.2.1]octane parent ring system // Journal of Molecular Structure. 2017. V.1130. P. 395-399. doi: 10.1016/j.molstruc.2016.10.065. 
• Britvin S.N., Rumyantsev A.M., Silyutina A.A., Padkina M.V. Palladium(II) and Platinum(II) Complexes of Novel Water-Soluble Phosphane CAP: Structure, Interligand Hydrogen-Hydrogen Bonding and in Vitro Cytotoxicity // ChemistrySelect. 2017. V.2. P.8721– 8725. doi: 10.1002/slct.201701819. 
• Цыганков М.А., Падкина М.В. Влияние сверхэкспрессии гена PpPDI на продукцию гетерологичных белков в дрожжах Pichia pastoris // Экологическая генетика. 2017. Т.15. №2. С.21-30. doi: 10.17816/ecogen15221-30.
• Падкина М.В., Самбук Е.В. Перспективы использования дрожжевого дисплея в биотехнологии и клеточной биологии (обзор) // Прикладная биохимия и микробиология. 2018. Т.54. № 4. С.329-346. doi: 10.7868/S0555109918040013. 
• Цыганков М.А., Падкина М.В. Клонирование промоторов генов PpKAR 2 и PpPDI1 дрожжей Pichia pastoris, оценка их активности и эффективности использования для экспрессии гетерологичных генов // Экологическая генетика. 2018. Т.16. №2. С.50–59. doi: 10.17816/ecogen16250-59..
• Самбук Е.В., Музаев Д.М., Румянцев А.М., Падкина М.В. Киллер-токсины дрожжей Saccharomyces cerevisiae: синтез, механизмы действия и практическое использование // Экологическая генетика. 2019. Т. 17. № 3. С. 59–73. https://doi.org/10.17816/ecogen17359-73.
• Al Shanaa, O.; Rumyantsev, A.; Sambuk, E.; Padkina, M. In Vivo Production of RNA Aptamers and Nanoparticles: Problems and Prospects. Molecules 2021, 26, 1422. https://doi.org/10.3390/molecules26051422.
• Румянцев А.М., Сидорин А.В., Самбук Е.В., Падкина М.В. Современные технологии производства вакцин против инфекционных болезней птиц // Экологическая генетика. 2021. Т. 19. № 3. С. 241–262. . DOI: https://doi.org/10.17816/ecogen71021
• Rumyantsev, A.; Sidorin, A.; Volkov, A.; Al Shanaa, O.; Sambuk, E.; Padkina, M. Transcriptome Analysis Unveils the Effects of Proline on Gene Expression in the Yeast Komagataella phaffii. Microorganisms 2022, 10, 67. https://doi.org/ 10.3390/microorganisms10010067 
• Burlakovskiy, M. ;  Saveleva, N.; Rumyantsev, A.;    Yemelyanov, V.; Padkina, M.;    Lutova, L. The Structure of T‐DNA Insertions in Transgenic Tobacco Plants Producing Bovine    Interferon‐Gamma. Appl. Sci. 2022, 12, 761. https://doi.org/10.3390/app12020761.
• Румянцев А.М., Цыганков М.А., Веретенников В.В., Самбук Е.В., Падкина М.В. Гетерологичный синтез фрагментов N и M капсидного белка VP2 вируса инфекционной бурсальной болезни птиц в дрожжах Pichia pastoris // Экологическая генетика. 2022. Т. 20. № 1. С. 49–59.  https://doi.org/10.17816/ecogen83441.
• Цыганков М.А., Румянцев А.М., Макеева А.С., Падкина М.В. Сравнение эффективности якорных белков ScAGα1p, KpCW51p, KpCW61p для поверхностного дисплея у дрожжей Komagataella phaffii // Экологическая генетика. 2022. Т. 20. № 4. С. 359-371. 
• Аль Шанаа У., Румянцев А.М., Самбук Е.В., Падкина М.В. Синтез флуоресцентного РНК-аптамерa Broccoli в клетках дрожжей Saccharomyces cerevisiae // Экологическая генетика. 2022. Т. 20. № 4. С.339-348. 
• Ianshina, T.; Sidorin, A.; Petrova, K.; Shubert, M.; Makeeva, A.; Sambuk, E.; Govdi, A.; Rumyantsev, A.; Padkina, M. Effect of Methionine on Gene Expression in Komagataella phaffii Cells. // Microorganisms 2023, 11, 877. https://doi.org/10.3390/microorganisms11040877
• Makeeva, A.; Muzaev, D.; Shubert, M.; Ianshina, T.; Sidorin, A.; Sambuk, E.; Rumyantsev, A.; Padkina, M. Alternative PCR-Based Approaches for Generation of Komagataella phaffii Strains // Microorganisms 2023, 11, 2297. https://doi.org/10.3390/microorganisms11092297
• Makeeva, A.; Sidorin, A.; Ishtuganova V.; Padkina, M.; Rumyantsev, A. Effect of Biotin Starvation on Gene Expression in Komagataella phaffii Cells // Biochemistry (Moscow), 2023, Vol. 88, No. 9, pp. 1368-1377. DOI: 10.1134/S000629792309016X
  

Учебники:

• Миронова Л.Н., Падкина М.В., Самбук Е.В. РНК: синтез и функции. СПб.: Изд-во Эко-Вектор. 2017. ISBN 978-5-906648-29-7. 287 с.

Патенты:

• α16-Интерферон человека (Патент РФ №2203950.  Бюл. №13. 2003),
• β-Интерферон человека (Патент РФ №2180687.  Бюл. №8. 2002), 
• γ-Интерферон быка (Патент РФ №2231545.  Бюл. №18.  2004), 
• γ-Интерферон человека (Патент РФ №2315806. Бюл. №3. 2008), 
• Интерлейкин-2 человека (Патент РФ №2315105. Бюл. №2. 2008).
• γ-Интерферон курицы (Патент РФ №2386694.  Бюл. №11.  2010), 
• γ-интерферон быка растения (Патент РФ №2564115. Бюл. №27. 2015)
• γ-Интерферон собаки (Патент РФ №2756852. Бюл. № 28, 2021).

Руководство текущими научно-исследовательскими работами

• ВКР аспиранта (2022): Аль Шанаа Усама «Разработка подходов синтеза РНК- аптамеров in vivo в дрожжевых клетках»
• Грант РФФИ №20-34-90139/20 «Разработка подходов к применению дрожжей в качестве объекта для синтеза и изучения свойств РНК-наночастиц». 2020-2022 г.г.

Другая профессиональная деятельность

Эксперт РНФ

Руководство кандидатскими диссертациями

• Парфенова Любовь Владимировна «Создание с помощью методов генной инженерии штаммов Saccharomyces cerevisiae и Pichia pastoris – продуцентов фибробластного интерферона человека, выделение и очистка рекомбинантного белка», 2002.
• Карабельский Александр Владимирович «Изучение факторов, влияющих на секрецию и биологическую активность химерного белка "Альбумин-интерферон-альфа16", синтезируемого дрожжами Pichia pastoris», 2010
• Градобоева Анастасия Евгеньевна «Экспрессия нативного и модифицированного генов иммунного интерферона быка в клетках дрожжей Saccharomyces cerevisiae и Pichia pastoris», 2010