Научные интересы:

Метагеномы нарушенных почв, бобово-ризобиальный симбиоз. 

Избранные публикации :

1. Кимеклис А.К., Кузнецова И.Г., Сазанова А.Л., Сафронова В.И., Белимов А.А., Онищук О.П., Курчак О.Н., Аксёнова Т.С., Пинаев А.Г., Андронов Е.Е., Проворов Н.А. Дивергентная эволюция симбиотических бактерий: ризобии реликтового бобового Vavilovia formosa формируют обособленную группу в пределах вида Rhizobium leguminosarum bv. viciae// Генетика, 2018, том 54, № 7, с. 1–5. doi:10.1134/S0016675818070068
2. A. K. Kimeklis, V. I. Safronova, A. A. Belimov, I. G. Kuznetsova, A. L. Sazanova, E. E. Andronov, N.A. Provorov. Divergence of nucleotide sequences of symbiotic genes indicates the early stages of speciation in Rhizobium leguminosarum bv. viciae isolated form relict legume Vavilovia formosa // Proceedings of the 20th International Congress on Nitrogen Fixation, Granada (Spain), 2017, p. 71
3. Кимеклис А.К., Кутовая О.В. Методы выделения и анализа почвенной ДНК. // В сборнике: Основные достижения и перспективы почвенной метагеномики Санкт-Петербург, 2017. С. 18-44.
4. Копать В.В., Чирак Е.Р., Кимеклис А.К., Сафронова В.И., Белимов А.А., Кабилов М.Р., Андронов Е.Е., Проворов Н.А. Эволюция генов fixNOQP, кодирующих цитохромоксидазу с высоким сродством к кислороду, у ризобий и родственных им бактерий. // Генетика. 2017. Т. 53. № 7. С. 795-804. doi: 10.7868/S0016675817070062
5. Проворов Н.А., Тихонович И.А., Андронов Е.Е., Воробьев Н.И., Онищук О.П., Курчак О.Н., Чижевская Е.П., Сафронова В.И., Белимов А.А., Кимеклис А.К., Чирак Е.Р., Жуков В.А., Долгих Е.А., Борисов А.Ю., Штарк О.Ю., Жернаков А.И., Сулима А.С., Копать В.В. Генетические основы эволюции ризобий – симбионтов растений. // Санкт-Петербург, 2016.
6. Чирак Е.Р., Копать В.В., Кимеклис А.К., Сафронова В.И., Белимов А.А., Чирак Е.Л., Тупикин А.Е., Андронов Е.Е., Проворов Н.А. Структурно-функциональная организация плазмидных регионов симбиотических генов у Rhizobium leguminosarum. // Микробиология. 2016. Т. 85. № 6. С. 693-702. doi: 10.7868/S0026365616060070
7. Леонова М.А., Афонюшкин В.Н., Андронов Е.Е., Кимеклис А.К. Метагеномный анализ микробиоты кишечника сельскохозяйственной птицы в новосибирской области. // Сборник научных трудов Всероссийского научно-исследовательского института овцеводства и козоводства. 2015. Т. 1. № 8. С. 453-455.
8. Кимеклис А.К., Сафронова В.И., Кузнецова И.Г., Сазанова А.Л., Белимов А.А., Пинаев А.Г., Чижевская Е.П., Пухаев А.Р., Попов К.П., Андронов Е.Е., Проворов Н.А. Филогенетический анализ штаммов рода Rhizobium, выделенных из клубеньков Vavilovia formosa (Stev.) Fed. Сельскохозяйственная биология, 2015, том 50, №5, стр 655-664. doi: 10.15389/agrobiology.2015.5.655rus
9. A.K. Kimeklis; V. I. Safronova; I. G. Kuznetsova; A. L. Sazanova; A. A. Belimov; E. E. Andronov; A. G. Pinaev; A. R. Pukhaev; K. P. Popov; J. A. Akopian; A. Willems. Relict Vavilovia formosa rhizobia-legume symbiosis: so unlike the others// VI International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology – BioMicroWorld2015, Barcelona (Spain), p.413, 2015
10. Safronova V.I., Kuznetsova I.G., Sazanova A.L., Kimeklis A.K., Belimov A.A., Andronov E.E., Pinaev A.G., Chizhevskaya E.P., Pukhaev A.R., Popov K.P., Willems A., Tikhonovich I.A. Bosea vaviloviae sp. nov., a new species of slow-growing rhizobia isolated from nodules of the relict species Vavilovia formosa (Stev.) Fed.// Antonie Van Leeuwenhoek, 2015 Apr; 107(4):911-20. doi: 10.1007/s10482-015-0383-9
11. Safronova V.I., Kuznetsova I.G., Sazanova A.L., Kimeklis A.K., Belimov A.A., Andronov E.E., Pinaev A.G., Pukhaev A.R., Popov K.P., Akopian J.A., Willems A., Tikhonovich I.A. Extra-slow-growing Tardiphaga strains isolated from nodules of Vavilovia formosa (Stev.) Fed.// Arch. Microbiol, 2015 Sep;197(7):889-98.  doi: 10.1007/s00203-015-1122-3
12. Safronova V.I., Kimeklis A.K., Chizhevskaya E.P., Belimov A.A., Andronov E.E., Pinaev A.G., Pukhaev A.R., Popov K.P., Tikhonovich I.A. Genetic diversity of rhizobia isolated from nodules of the relic species Vavilovia formosa (Stev.) Fed.// Antonie van Leeuwenhoek, 2014, V.105, p.389–399. doi: 10.1007/s10482-013-0089-9
13. Anastasiia K. Kimeklis, Vera I. Safronova, Elena P. Chizhevskaya, Andrey A. Belimov, Evgeny E. Andronov, Andrey R. Pukhaev, Konstantin P. Popov. Phylogenetic diversity among rhizobia isolated from the relict leguminous plant Vavilovia formosa (Stev.) Fed. growing in North Ossetia // Book of Abstracts, V International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology - BioMicroWorld2013, Madrid, Formatex, p. 54, 2013.
14. Кимеклис А.К., Сулима А.С., Сафронова В.И., Белимов А.А., Чижевская Е.П., Пинаев А.Г., Пухаев А.Е., Попов К.П., Андронов Е.Е. Особенности симбиотических систем реликтового бобового растения Vavilovia formosa (Stev.) An. Fed. и его ризобий// 18-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых «Биология – наука XXI века», Сборник тезисов, Пущино, 2014, стр. 212-213.
15. Кимеклис А.К., Сафронова В.И., Белимов А.А., Чижевская Е.П., Пинаев А.Г., Проворов Н.А., Пухаев А.Е., Попов К.П., Андронов Е.Е. Vavilovia formosa: новая генетическая модель для изучения эволюции бобово-ризобиального симбиоза// VI Съезд ВОГиС и ассоциированные генетические симпозиумы, Сборник тезисов, Ростов-на-Дону, 2014, стр. 202-203.
16. Кимеклис А.К., Сафронова В.И., Чижевская Е.П., Белимов А.А., Пухаев А.Е., Попов К.П., Андронов Е.Е. Филогенетический анализ микросимбионтов Vavilovia formosa в хромосомных и симбиотических участках генома// 17-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых «Биология – наука XXI века», Пущино, 2013.
17. Safronova V.I., Piluzza G., Zinovkina N.Y., Kimeklis A.K., Belimov A.A., Bullitta S. Relationships between pasture legumes, rhizobacteria and nodule bacteria in heavy metal polluted mine waste of SW Sardinia// Symbiosis, 2012, Volume 58, Issue 1-3, pp 149-159
18. Кимеклис А.К., Петрова С.Н., Першина Е.В., Пинаев А.Г., Андронов Е.Е. Перспективы использования данных анализа днк почвенного микробиома в оценке агроэкологического состояния почв// VI съезд общества почвоведов им. В. В. Докучаева, Петрозаводск-Москва, 2011.