|
Карьера
Окончил СПбГУ в 2003 г. Аспирант СПбГУ: 2004-2007. Работал в Технологическом институте Джорджии, Атланта, США – 2007. Защитил степень к.б.н. – 2008. Работа на кафедре генетики и биотехнологии СПбГУ: 2002-2011 – младший научный сотрудник, 2011-2022 – научный сотрудник. Стажировка в Медицинском центре штата Небраска (UNMC), США – 2012. Работа в СПбФ Института общей генетики им. Н.И.Вавилова – 2007-2013 научный сотрудник. Работа в Научной лаборатории биологии амилоидов, СПбГУ: 2013-2021 – заместитель руководителя, с 2022 – руководитель лаборатории. Работа в Научно-Технологическом Университете «Сириус»: 2020-2021.
Научные интересы:
Амилоиды, прионы, дрожжевые модели, болезнь Альцгеймера, амилоидозы, функциональные амилоиды, биоконденсаты, шапероны.
Читаемые курсы:
- Молекулярно-биологические методы (практикум)
Избранные публикации:
- Kulichikhin K.Y., Fedotov S.A., Rubel M.S., Zalutskaya N.M., Zobnina A.E., Malikova O.A., Neznanov N.G., Chernoff Y.O., Rubel A.A. Development of molecular tools for diagnosis of Alzheimer's disease that are based on detection of amyloidogenic proteins. Prion. 2021 Dec;15(1):56-69.Doi:10.1080/19336896.2021.1917289.
- Bozhokin M.S., Bozhkova S.A., Rubel A.A., Sopova J.V., Nashchekina Y.A., Bildyug N.B., Khotin MG. Specificities of Scanning Electron Microscopy and Histological Methods in Assessing Cell-Engineered Construct Effectiveness for the Recovery of Hyaline Cartilage. Methods Protoc. 2021 Oct 27;4(4):77. doi: 10.3390/mps4040077.
- Rubel M.S., Fedotov S.A., Grizel A.V., Sopova J.V., Malikova O.A., Chernoff Y.O., Rubel A.A. Functional Mammalian Amyloids and Amyloid-Like Proteins. Life (Basel). 2020 Aug 21;10(9):156. Doi: 10.3390/life10090156.
- Chernoff Y.O., Grizel A.V., Rubel A.A., Zelinsky A.A., Chandramowlishwaran P., Chernova T.A. Application of yeast to studying amyloid and prion diseases. Adv Genet. 2020;105:293-380. Doi:10.1016/bs.adgen.2020.01.002.
- Kachkin D.V., Khorolskaya J.I., Ivanova J.S., Rubel A.A. An Efficient Method for Isolation of Plasmid DNA for Transfection of Mammalian Cell Cultures. Methods Protoc. 2020 Oct 14;3(4):69. Doi: 10.3390/mps3040069.
- Bozhokin M.S., Sopova, Y.V., Kachkin D.V., Rubel A.A., Khotin M.G., Mechanisms of TGFbeta3 action as a therapeutic agent for promoting the synthesis of extracellular matrix proteins in hyaline cartilage. Biochemistry (Mosc.) 85:4 (Apr 2020), 436–447, Doi: 10.1134/S0006297920040045.
- Gerasimova E.M., Fedotov S.A., Kachkin D.V., Vashukova E.S., Glotov A.S., Chernoff Y.O., Rubel A.A. Protein Misfolding during Pregnancy: New Approaches to Preeclampsia Diagnostics. Int J Mol Sci. 2019 Dec 7;20(24):6183. Doi: 10.3390/ijms20246183.
- Chandramowlishwaran P., Sun M., Casey K.L., Romanyuk A.V., Grizel A.V., Sopova J.V., Rubel A.A, Nussbaum-Krammer C, Vorberg IM, Chernoff YO. Mammalian amyloidogenic proteins promote prion nucleation in yeast. J Biol Chem. 2018 Mar 2;293(9):3436-3450. Doi: 10.1074/jbc.M117.809004.
- Rubel A.A., Saifitdinova A.F., Romanova N.V. Protein assembly disorders and protein-based inheritance. Genetics, Evolution and radiation (Korogodina V.L., Mothersill C.E., Inge-Vechtomov S.G., Seymour C.B. Eds.) Springer Verlag International Publishing AG (ISBN 978-3-319-48837-0, 978-3-319-48838-7 eBook.) 2017. P. 85-105. Doi: 10.1007/978-3-319-48838-7_8.
- Grizel A.V., Rubel A.A., Chernoff Y.O. Strain conformation controls the specificity of cross-species prion transmission in the yeast model. Prion. 2016 Jul 3;10(4):269-82. Doi: 10.1080/19336896.2016.1204060.
- Rubel A.A., Ryzhova T.A., Antonets K.S., Chernoff Y.O., Galkin A. Identification of PrP sequences essential for the interaction between the PrP polymers and Aβ peptide in a yeast-based assay. Prion. 2013 Nov-Dec;7(6):469-76. Doi: 10.4161/pri.26867.
- Rubel A.A., Korzhova V., Saifitdinova A.F., Antonez K.S., Inge-Vechtomov S.G., Galkin A.P. Prion protein and amyloid beta peptide interact in the yeast Saccharomyces cerevisiae. March 2012. Ecological Genetics 10(1):74-80. Doi: 10.17816/ecogen10174-80.
- Инге-Вечтомов С.Г., Галкин А.П., Сопова Ю.В., Рубель А.А. Прионы, "белковая наследственность" и эпигенетика C. 481-498 / Эпигенетика. Издательство СО РАН (Сибирского отделения Российской академии наук) - 2012. 592 с.
- Nizhnikov A.A., Magomedova Z.M., Rubel A.A., Kondrashkina A.M., Inge-Vechtomov S.G., Galkin A.P. [NSI+] determinant has a pleiotropic phenotypic manifestation that is modulated by SUP35, SUP45, and VTS1 genes. Curr Genet. 2012 Feb;58(1):35-47. Doi: 10.1007/s00294-011-0363-1.
- Lada A.G., Dhar A., Boissy R.J., Hirano M., Rubel A.A., Rogozin I.B., Pavlov Y.I. AID/APOBEC cytosine deaminase induces genome-wide kataegis. Biol Direct. 2012. Dec 18;7:47.Doi:10.1186/1745-6150-7-47.
- Saifitdinova A.F., Nizhnikov A.A., Lada A.G., Rubel A.A., Magomedova Z.M., Ignatova V.V., Inge-Vechtomov S.G., Galkin A.P. [NSI+]: a novel non-Mendelian nonsense suppressor determinant in Saccharomyces cerevisiae. Curr Genet. 2010 Oct;56(5):467-78. Doi: 10.1007/s00294-010-0314-2.
- Rogoza T., Goginashvili A., Rodionova S., Ivanov M., Viktorovskaya O., Rubel A., Volkov K., Mironova L. Non-Mendelian determinant [ISP+] in yeast is a nuclear-residing prion form of the global transcriptional regulator Sfp1. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Jun 8;107(23):10573-7. Doi: 10.1073/pnas.1005949107.
- Rubel A.A., Saifitdinova A.F., Lada A.G., Nizhnikov A.A., Inge-Vechtomov S.G., Galkin A.P. Yeast chaperone Hsp104 controls gene expression at the posttranscriptional level. Mol Biol (Mosk). 2008 Jan-Feb;42(1):123-30. Russian. doi: 10.1134/s0026893308010184.
- Галкин А.П., Цапонина О.Е., Рубель А.А., Наволоцкая В.В., Лада А.Г., Петрова И.Т., Смирнов А.Ф., Инге-Вечтомов С.Г. Гибридный ген PCUP1-Аβ-Sup35MC для анализа факторов, регулирующих продукцию, агрегацию и дисагрегацию пептида амилоид β (Аβ) человека в дрожжевой системе. 2007. Патент РФ RU №2294964.2007.
- Цапонина О.Е., Лада А.Г., Рубель А.А., Наволоцкая В.В, Петрова И.Т., Инге-Вечтомов С.Г., Галкин А.П. Аналз эффектов продукции гибридного белка Аβ-Sup35MC в дрожжах Saccharomyces cerevisiae. Экологическая генетика. 2005. Т. 3. Вып. 1. С. 24-33.
Руководство текущими научно-исследовательскими работами
Поиск и анализ новых амилоидогенных белков в протеоме человека.
Выявление мутаций, влияющих на амилоидогенез пептида Abeta42, и изучение механизма их эффектов.
Изучение механизмов межвидовой передачи прионов.
Разработка подходов для не инвазивной диагностики амилоидозов.
Изучение роли неструктурированных участков дрожжевого белка Sup35 в формировании биоконденсатов.
Награды и гранты
Заместитель руководителя (2013-2021) и руководитель (2022) проекта «Mega_SPbU_2013» (Мегагрант СПбГУ на создание лабораторий под руководством ведущих мировых учёных).
Победитель конкурса лучших инновационных проектов в сфере науки и высшего образования Санкт-Петербурга в 2018 году (в составе коллектива).
Руководитель гранта Российского Фонда Фундаментальных исследований (конкурс А) (конкурс 2015 г.)
Руководитель проектов ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009-2013 гг., мероприятие 1.2.2 Проведение научных исследований научными группами под руководством кандидатов наук (конкурсы 2010 и 2012 гг).
Руководитель проектов ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009-2013 гг., мероприятие № 1.3.1 Проведение научных исследований молодыми учеными-кандидатами наук (конкурсы 2009 и 2010 гг).
Победитель конкурсов грантов Комитета по науке и высшей школе Правительства Санкт-Петербурга, для аспирантов (2004-2006 гг); молодых учёных (2008 г), молодых кандидатов наук (2009, 2010, 2012 гг).
Другая профессиональная деятельность
Преподаватель модулей: «Инструменты редактирования генома»; «Геномика и геномный анализ».
|
