Научные интересы:

Биохимия антимикробных пептидов системы врожденного иммунитета человека и животных; разработка синтетических аналогов природных пептидов с целью создания прототипов новых антибиотических или иммуномодулирующих лекарственных препаратов.

Направление исследований

Более 30 лет работает в области изучения антимикробных пептидов врожденного иммунитета; в ходе этой работы открыто более десяти новых антимикробных пептидов разных структурных классов в лейкоцитов животных (бактенецины, аципенсины и др.), исследованы механизмы их действия на бактериальные и эукариотические клетки, показана перспективность применения этих соединений в качестве прототипов новых антибиотических средств. Установлено, что исследуемые пептиды не только анитимикробные, но и полифункциональные молекулы, для ряда пептидов показана возможность их участия во взаимодействии иммунной и нейроэндокринной систем, стресс-протективная активность, ранозаживляющая активность, некоторые пептиды обладают противоопухолевыми свойствами. Разрабатываются структурные модификации природных пептидов с оптимизированными для практического применения свойствами. Ряд структур запатентован.

Читаемые курсы:

• Курс «Ко- и пост-трансляционные ковалентные модификации белков»
• «Современные проблемы биомедицины»

Избранные публикации:

• Chernov A.N., Tsapieva A., Filatenkova T.A., Galimova E.S., Shamova O.V., Suvorov A.N., Alaverdian D.A., Suvorova M. In vitro evaluation of the cytotoxic effect of Streptococcus pyogenes strains, protegrin PG-1, cathelicidin LL-37, nerve growth factor and chemotherapy on the C6 glioma cell line // Molecules. 2022. Т. 27. № 2. https://doi.org/10.3390/molecules27020569 Q2
• Tkachev P.V., Pchelin I.M., Azarov D.V., Gorshkov A.N., Shamova O.V., Dmitriev A.V., Goncharov A.E. Two novel lytic bacteriophages infecting enterococcus spp. are promising candidates for targeted antibacterial therapy // Viruses. 2022. Т. 14. № 4. https://doi.org/10.3390/v14040831 Q2
• Ekaterina Yuskina, Nikodim Makarov, Maria Khaydukova, Tatiana Filatenkova, Olga Shamova, Valentin Semenov, Vitaly Panchuk, and Dmitry Kirsanov. A Simple Contactless High-Frequency Electromagnetic Sensor: Proof of Concept // Analytical Chemistry 2022 94 (35), 11978-11982 DOI: 10.1021/acs.analchem.2c02067 Q1
• O. Golubeva, N. Ulyanova, E. Vladimirova, O. Shamova. Comparison of the antimicrobial and hemolytic activities of silver ions, silver nanoparticles and Agо/Lyz bioconjugates stabilized in zeolite matrix // Langmuir. Manuscript ID: la-2021-018993 10.1021/acs.langmuir.1c01899 (Q2)
• O.Y. Golubeva, Y.A. Alikina, T.V. Khamova, E.V. Vladimirova, O.V. Shamova. Aluminosilicate nanosponges: synthesis, properties and application prospects// Inorganic Chemistry (American Chemical Society). 2021, 60, 22, 17008–17018. 10.1021/acs.inorgchem.1c02122 (Q1)
• M.S. Zharkova, O.Y. Golubeva, D.S. Orlov, E.V. Vladimirova, A.V. Dmitriev, A. Tossi, O.V. Shamova. Silver nanoparticles functionalized with antimicrobial polypeptides - benefits and possible pitfalls of a novel anti-infective tool.// Front. Microbiol. 2021. -12:750556.   10.3389/fmicb.2021.750556 Q1
• Eliseev, I.E.; Ukrainskaya, V.M.; Yudenko, A.N.; Mikushina, A.D.; Shmakov, S.V.; Afremova, A.I.; Ekimova, V.M.; Vronskaia, A.A.; Knyazev, N.A.; Shamova, O.V. Targeting ErbB3 Receptor in Cancer with Inhibitory Antibodies from Llama// Biomedicines 2021, 9, 1106. 10.3390/biomedicines9091106 (Q1)
• А.Н. Чернов, И.А. Балдуева, Т.Л. Нехаева, Э.С. Галимова, Д.А. Алавердиан, О.В. Шамова. Молекулярные механизмы множественной лекарственной устойчивости глиобластом человека // Вопросы онкологии, 2021 Том 67, № 1. – С. 20-28. doi: 10.37469/0507-3758-2021-67-1-20-28
• N. Yu. Ulyanova, L. N. Kurylenko, O. V. Shamovа, D. S. Orlov, O. Yu. Golubeva. Hemolitic Activity and Sorption Ability of Beta Zeolite Nanoparticles // Glass Physics and Chemistry, 2020, Vol. 46, No. 2, pp. 155–161). Scopus, WoS, Q4
• Kopeikin P.M., Zharkova M.S., Kolobov A.A., Smirnova M.P., Sukhareva M.S., Umnyakova E.S., Kokryakov V.N., Orlov D.S., Milman B.L., Balandin S.V., Panteleev P.V., Ovchinnikova T.V., Komlev A.S., Tossi A., Shamova O.V. Caprine Bactenecins as Promising Tools for Developing New Antimicrobial and Antitumor Drugs // Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. — 2020. — Vol. 10 —Article 52905. DOI: 10.3389/fcimb.2020.552905 (Q2). 
• Smirnova, M.P, Kolodkin, N.I., Kolobov, A.A., Afonin, V.G., Afonina, I.V., Stefanenko, L.I., Shpen, V.M, Shamova, O.V. Indolicidin analogs with broad-spectrum antimicrobial activity and low hemolytic activity // Peptides – 2020. - Vol. 132-  Art: 170356. DOI: 10.1016/j.peptides.2020.170356 (Q2). 
• Krenev I.A., Umnyakova E.S., Eliseev I.E., Dubrovskii Y.A., Gorbunov N.P., Pozolotin V.A., Komlev A.S., Panteleev P.V., Balandin S.V., Ovchinnikova T.V., Shamova O.V., Berlov M.N. Atimicrobial peptide arenicin-1 derivative Ar-1-(C/A) as complement system modulator // Marine Drugs. - 2020. - Vol. 18. - Art: 631. DOI: 10.3390/md18120631 (Q2). 
• Alexandr N. Chernov, Diana A. Alaverdian, Oleg S. Glotov, Michael V. Talabaev, Stanislav P. Urazov, Sergei G. Shcherbak, Alessandra Renieri, Elisa Frullanti and Olga Shamova. Related expression of TRKA and P75 receptors and the changing copy number of MYC-oncogenes determine the sensitivity of brain tumor cells to the treatment of the nerve growth factor in combination with cisplatin and temozolomide // Drug Metabol Pers Ther. - 2020. DOI: 10.1515/dmpt-2020-0109 (S).
• Umnyakova ES, Zharkova MS, Berlov MN, Shamova OV, Kokryakov VN. Human antimicrobial peptides in autoimmunity // Autoimmunity. – 2020 – pp. 1–11. doi:10.1080/08916934.2020.1711517   Q4 WoS
• Orlov D.S., Shamova O.V., Eliseev I.E., Zharkova M.S., Chakchir O.B., Antcheva N., Zachariev S., Panteleev P.V., Kokryakov V.N., Ovchinnikova T.V., Tossi A. Redesigning arenicin-1, an antimicrobial peptide from the marine polychaeta Arenicola marina, by strand rearrangement or branching, substitution of specific residues, and backbone linearization or cyclization.  Marine Drugs. 2019 Jun 23;17(6). pii: E376. doi: 10.3390/md17060376. https://www.mdpi.com/1660-3397/17/6/376  Q2 Web of Science 
• M.S. Zharkova, D.S. Orlov, O.Yu. Golubeva, O.B. Chakchir, I.E. Eliseev, T.M. Grinchuk, O.V. Shamova. Application of antimicrobial peptides of the innate immune system in combination with conventional antibiotics - a novel way to combat antibiotic resistance? // Front. Cell. Infect. Microbiol. - 30 April 2019.  https://doi.org/10.3389/fcimb.2019.00128  Q2 Web of Science. 
• I. E. Eliseev, I. N. Terterov, A. N. Yudenko, O. V. Shamova. Linking sequence patterns and functionality of alpha-helical antimicrobial peptides // Bioinformatics, – 2019. – Vol. 15 (16). – P. 2713-2717.            https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty1048  (Impact factor 5.481, Q1) 
• Panteleev P.V., Bolosov I. A., Kalashnikov A. A.,  Kokryakov V. N., Shamova O. V.,  Emelianova A.A., Balandin S.V., Ovchinnikova T.V. Combined antibacterial effects of goat cathelicidins with different mechanisms of action // Front. Microbiol., 2018. - Vol. 9, Article 2983, P. 1-19.     DOI: 10.3389/fmicb.2018.02983, (Impact Factor 4.019,  Q1), https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2018.02983/full
• Golubeva O.Y., Brazovskaya E.Y., Shamova O.V. Biological activity and sorption ability of synthetic montmorillonite modified by silver/lysozyme nanoparticles // Applied Clay Science. 2018. Т. 163. С. 56-62 DOI: 10.1016/j.clay.2018.07.015 (Impact Factor: 3.35, Q1). http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1387181116000081
• Müller A., Grein F., Schneider T., Sahl H.-G., Otto A., Becher D., Gries K., Orlov D., Shamova O., Zarubaev V., Girard M., François P., Sher X., Roemer T. Differential daptomycin resistance development in Staphylococcus aureus strains with active and mutated gra regulatory systems // International Journal of Medical Microbiology. 2018. Т. 308. № 3. С. 335-348.DOI: 10.1016/j.ijmm.2017.12.002 (Impact factor 3.3, Q2)   https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1438422117303958
• Golubeva O.Y., Ulyanova N.Y., Zharkova M.S., Shamova O.V. Synthesis and study of zeolites modified by silver nanoparticles and clusters: biological activity // Glass Physics and Chemistry. - 2018. - Т. 44, № 6. - С. 586-590). DOI 10.1134/S108765961806007X Scopus, WoS Q4
• Zharkova, M.S., Kopeykin, P.M., Afinogenov, G.E.,  Orlov, D.S., Artamonov, A.Yu., Safiullina, K.E., Sukhareva, M.S., Tsvetkova, E.V., Milman, B.L., Afinogenova, A.G, Shamova, O.V. Effects of proline-rich peptides of the innate immune system on drug-resistant bacterial strains // Medical Immunology (Russia). - 2018. - Vol. 20, No 1,  PP. 107-114). http://mimmun.ru/mimmun . (Scopus) DOI: 10.15789/1563-0625-2018-1-107-114
• Е.В. Цветкова, Г.М. Алешина, Л.Е. Леонова, О.В. Шамова, Е.В. Романовская, В.Н. Кокряков. Функциональные свойства θ-дeфенсинов из лейкоцитов крови  гамадрила Papio hamadryas // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2018. – № 5. – С. 66-73. DOI: 10.36233/0372-9311-2018-5-66-73 
• O.V. Shamova, D.S. Orlov, M.S. Zharkova, S.V. Balandin, E.V. Yamschikova, D. Knappe,R. Hoffmann, V.N. Kokryakov3, T.V. Ovchinnikova. Minibactenecins ChBac7.Nα and ChBac7.Nβ - antimicrobial peptides from leukocytes of the goat Capra hircus // Acta Naturae, 2016. - Vol. 8, № 3 (30), P. 136-146). http://actanaturae.ru/ Q4 PubMed ID: 27795854 DOI: 10.32607/20758251-2016-8-3-136-146
• Tsvetkova E. V., Leonova L. E. , Aleshina G. M., Shamova O. V., Romanovskaya E. V., Mavropulo-Stolyarenko G. R., Kokryakov V. N. Antimicrobial effects of alpha-defensins from leukocytes of the hamadryas baboon Papio hamadryas //Journal of Evolutionary Biochemistry and Physiology, 2016, Vol. 52, No 2, P. 133–140.  (http://link.springer.com/article/10.1134/S0022093016020046). Q4 DOI: 10.1134/S0022093016020046 
• O. Yu. Golubeva , O. V. Shamova, A. V. Yakovlev, M. S. Zharkova. Synthesis and Study of the Biologically Active Lysozyme–Silver Nanoparticles–Montmorillonite K10 Complexes // Glass Physics and Chemistry. – 2016. - Vol. 42, No. 1. - pp. 84–91) (http://link.springer.com/article/10.1134/S1087659616010041)  Q4 DOI: 10.1134/S1087659616010041 
• Е.С. Умнякова, И.В. Кудрявцев, Н.А. Грудинина, С.В. Баландин, И.А. Болосов, П.В. Пантелеев, Т.А. Филатенкова, Д.С. Орлов, Е.В. Цветкова, Т.В. Овчинникова, В.Н. Кокряков, О.В. Шамова. Интернализация антимикробного пептида аципенсина 1 в опухолевые клетки человека // Медицинская иммунология. - 2016, Т. 18, № 6, стр. 581-588. http://mimmun.ru/mimmun (Scopus) DOI: 10.15789/1563-0625-2016-6-575-582
• S.V. Balandin, A.A. Emelyanova, M.B. Kalashnikova, V.N. Kokryakov, O.V. Shamova, T.V. Ovchinnikova. Molecular Mechanisms of Anticancer Action of Natural Antimicrobial Peptides // Bioorganicheskaya Khimiya (Russian Journal of Bioorganic Chemistry),   2016, Vol. 42, № 6, P. 633–648. http://elibrary.ru/item.asp?id=27222697 DOI: 10.7868/S0132342316060026  Scopus, WoS. Q4
• Shamova O.V., Orlov D.S., Balandin S.V., Shramova E.I., Tsvetkova E.V., Panteleev P.V., Leonova Yu.F., Tagaev A.A., Kokryakov V.N. Ovchinnikova  Acipensins – novel antimicrobial peptides from leukocytes of the Russian sturgeon Acipenser gueldenstaedtii // Acta Naturae. -2014. - Vol. 6, № 4 (23). –P. 99-109.
• O.Yu.Golubeva, O.V.Shamova, D.S.Orlov, E.V.Yamshchikova, A.S.Boldina, V.N. Kokryakov.  Synthesis and investigation of silver-peptide bioconjugates and investigation in their antimicrobial activity // in a book: Materials challenges and testing for supply of energy and resources (Ed. by T.Bollinghaus, J. Lexow, T.Kishi, M.Kitagawa). – Springer. – 2012. – P. 163-171. 
• Golubeva O.Y., Boldina A.S., Drozdova I.A., Shamova O.V., Orlov D.S., Pazina T.Y., Kokryakov V.N. Synthesis and study of antimicrobial activity of bioconjugates of silver nanoparticles and endogenous antibiotics  // Glass Physics and Chemistry. - 2011. - Т. 37, № 1. - С. 78-84 
• Golubevaa O.Y., Boldina A.S., Shamova O.V., Orlov D.S., Pazina T.Y., Kokryakov V.N Study of antimicrobial and hemolytic activities of silver nanoparticles prepared by chemical reduction // Glass Physics and Chemistry. - 2010. - Т. 36, № 5. -  С. 628-634
• Sass V.,Schneider T. Wilmes M. Körner C. Tossi A. Novikova N. Shamova O., Sahl HG. Human beta-defensin 3 inhibits cell wall biosynthesis in Staphylococci. // Infection and Immunity. 2010.  Vol. 78, N. 6. PP. 2793-2800.
• Shamova O.,Orlov D.,Stegemann C.,  Czihal P.,  Hoffmann R., Brogden K., Kolodkin N., Sakuta G. , Tossi A., Sahl H-G., Kokryakov V., Lehrer R.I. ChBac3.4: A novel proline-rich antimicrobial peptide from goat leukocytes // International Journal of Peptide Research and Therapeutics. 2009, Vol. 15, N 1, P.31-35. 
• Stegemann C. Kolobov A. Leonova Yu. Shamova O. Ovchinnikova T. Kokryakov V. Hoffmann R.  Isolation, purification and de novo sequencing of TBD-1, the first beta-defensin from leukocytes of reptiles // Proteomics. - 2009. - Vol.9, N 5. -P. 1364-1373.
• Pag U. Oedenkoven M. Sass V.,  Shai Y., Shamova O. Antcheva N. Tossi A.  Sahl HG. Analysis of in vitro activities and modes of action of synthetic antimicrobial peptides derived from an alpha-helical 'sequence template'. // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. – 2008. - Vol. 61, N 2. -  P. 341-352.
• Шамова О.В. , Сакута Г.А, Орлов Д.С., Зенин В.В., Штейн Г.И., Колодкин Н.И., Афонина И.Н., Кокряков В.Н. Действие антимикробных пептидов из нейтрофильных гранулоцитов на опухолевые и нормальные клетки в культуре // Цитология. – 2007. - Том 49, № 12. - стр. 1000-1010.
• Albrecht M.T., Wang W., Shamova O., Lehrer R.I., Schiller N.L. Binding of protegrin-1 to Pseudomonas aeruginosa and Burkholderia cepacia // Respiratory Research. – 2002. - V.3, N1 (18). Online  http://respiratory-research. com/content/pdf/RR-3-1-18.pdf.
• Zhao C., Nguen T, Liu L., Shamova O., Brogden K.A. , Lehrer R.I. Differential expression of caprine beta-defensins in digestive and respiratory tissues // Infection and Immunity. – 1999. - V.67, N 11. - P.6221-6224.
• Shamova O.V., Brogden K.A., Zhao C., Nguen T., Turner J., Kokryakov V.N., Lehrer R.I.  Purification and properties of proline-rich antimicrobial peptides from sheep and goat leukocytes  // Infection and Immunity. – 1999. - V.67, N 8, -P.4106-4111.
• Korneva E.A., Rybakina E.G. , Kokryakov V.N., Orlov D.S., Shamova O.V., Shanin S.N. Interleukin 1 and defensins in thermoregulation, stress and immunity // Annals of NY Acad. Sci.- 1997. - V. 813. P. 465-473.
• Harvig S.S.L., Kokryakov V.N., Swiderek K.H., Panyutich E.A., TanL., Lee T.D., Aleshina G.V., Shamova O.V., Lehrer R.I. Gallinacins: cysteine-rich antimicrobial peptides of chicken leukocytes // FEBS Letters. – 1994. - V.342. - P. 281-285.
• Kokryakov V.N., Harvig S.S.L., Panyutich E.A., Shevchenko A.A., Aleshina G.V., Shamova O.V., Korneva E.A., Lehrer R.I. Protegrins: leukocyte antimic-robial peptides that combine features of corticostatic defen-sins and tachyplesins //  FEBS Letters. – 1993. - V. 327, N 2. – P. .231-236.
• Mirgorodskaya O.A., Shavchenkko A.A, Kamal O.M.A., Chernushevich I.V., Egorov T., Musoliamov A.X., Kokryakov V.N., Shamova O.V. Primary structure of three cationic peptides from porcine neutrophils. Sequence determination by combined usage of electrospray ionization mass spectrometry and Edman degradation // FEBS Letters. – 1993. - V. 330, N 3.  P. 339-342.
• Шамова О.В., Лесникова М.П., Кокряков ВН., Шхинек Э.К., Корнева Е.А. Действие дефенсинов на уровень кортикстерона в крови и иммунный ответ при стрессе // Бюлл. экспер. биол. и мед. – 1993. - N 6, т.CXV. - С. 646-649.
• Петрова Т.А., Шамова О.В., Лызлова С.Н. Сравнительно-энзимологический анализ креатинкиназ из скелетных мышц трески, лягушки и кролика // Журнал эволюци-онной биохимии и физиологии. – 1988. -  Т. 24, N 4. - С.489-496.
• E. Umnyakova, D. Orlov, O. Shamova. Peptides and antibiotic resistance. In a Book / Peptide and Peptidomimetic Therapeutics. From Bench to Bedside. (Edited by Nir Qvit and  Samuel J.S. Rubin). Academic Press; 1st edition. 2022. 792 pp. – P. 417-438. ISBN – 978-0-12-820141-1 

Патенты на изобретения, полезные модели, программы для ЭВМ:

• Шамова О.В., Жаркова М.С., Умнякова Е.С., Копейкин П.М., Сухарева М.С., Комлев А.С., Овчинникова Т.В., Баландин С.В., Пантелеев П.В., Климов Н.А. «Пептид, обладающий противоопухолевой активностью» Патент на изобретение  2771492 C1, 05.05.2022. Заявка № 2021110761 от 15.04.2021.
• Шамова О.В., Жаркова М.С., Орлов Д.С., Комлев А.С., Владимирова Е.В., Овчинникова Т.В., Пантелеев П.В., Баландин С.В., Климов Н.А. «Пептид, обладающий антибактериальной активностью в отношении микроорганизмов с множественной лекарственной устойчивостью» Патент на изобретение  2771493 C1, 05.05.2022. Заявка № 2021110763 от 15.04.2021.
• Елисеев И.Е., Тертеров И.Н., Шамова О.В Синтетический пептид лексицин-1, обладающий антимикробным действием. Патент на изобретение RU 2715854 C1, 03.03.2020. Заявка № 2019120356 от 28.06.2019.
• Пантелеев П.В., Емельянова А.А., Болосов И.А., Баландин С.В., Шамова О.В., Овчинникова Т.В. Пептид, проявляющий антибактериальные и противоопухолевые свойства. Заявка на патент №2019116012 от 24.05.2019. Патент RU № 2702661. Решение о выдаче патента от 28.08.2019. Зарегистрирован 09.10.2019.
• Пантелеев П.В., Баландин С.В., Болосов И.А., Емельянова А.А., Кокряков В.Н., Шамова О.В., Овчинникова Т.В. Пептид, обладающий противоопухолевой активностью. Патент на изобретение RU 2658781 C1, 22.06.2018. Заявка № 2017146644 от 28.12.2017.
• Баландин С.В., Пантелеев П.В., Болосов И.А., Шамова О.В., Кокряков В.Н., Овчинникова Т.В. Плазмидный вектор pET-His8-TrxL-Acip1, штамм бактерии Escherichia coli BL21(DE3)/pET-His8-TrxL-Acip1 для экспрессии антимикробного пептида аципенсина-1 и способ получения указанного пептида // Патент RU 2580031 от 10.04.2016 (заявка №2015109081 от 16.03.2015; дата публикации заявки 20.07.2015).
• Баландин С.В., Болосов И.А., Емельянова А.А., Кокряков В.Н., Пантелеев, П.В., Шамова О.В., Овчинникова Т.В. Плазмидный вектор pET-TrxGom, штамм бактерии Escherichia coli BL21(DE3)/pET-TrxGom для экспрессии  антимикробного пептида гомезина, обладающего противоопухолевой активностью, и способ получения указанного пептида // Заявка на патент РФ №2016137494 от 20.09.2016.
• Баландин С.В., Болосов И.А., Пантелеев П.В., Кокряков В.Н., Шамова О.В., Овчинникова Т.В. Плазмидный вектор pET-mChBac75Na, штамм бактерии Escherichia coli BL21(DE3)/ pET-mChBac75Na для экспрессии антимикробного пептида минибактенецина ChBac7.5Na и способ получения указанного пептида // Патент RU 2618850 от 11 мая 2017 г. (Заявка на патент РФ №2016123389 от 14.06.2016).
  

Некоторые научные проекты:

• № 17-04-02177а Название проекта: «Изучение биологической активности и структурных свойств пролин-богатых пептидов млекопитающих как многофункциональных защитных молекул и перспективных прототипов новых лекарственных средств» 2017-2019 гг.
• Гранты РФФИ - №13-04-02102а Изучение молекулярно-клеточных механизмов совместного действия  антимикробных белков и пептидов нейтрофильных гранулоцитов и их роли в реализации защитных реакций организма.
• 2013-201507-04-01759-а Изучение роли катионных антимикробных пептидов нейтрофильных гранулоцитов в реализации различных защитных функций организма 2007-2009г..
• №03-04-49747-а Антимикробные пептиды как молекулярные факторы противоопухолевой активности нейтрофильных гранулоцитов 2003-2005.

• ФНИ № 0557-2019-0010 Патофизиологические основы нарушений взаимодействия нервной и иммунной систем и поиск инновационных путей коррекции различных форм патологии (2019-2021 гг.).
• ФНИ № 0424-2019-0001 "Применение генно-инженерных подходов к созданию рекомбинантных препаратов против патогенных микроорганизмов" (2019-2921 гг.) соруководитель. 
• ФНИ № 0557-2016-0010 Молекулярные механизмы функционирования и взаимодействия интегративных систем организма (нейроэндокринной и иммунной) и подходы к коррекции их нарушений (2016-2018).