В состав отдела биохимии института физиологии им. А.А.Ухтомского входят пять лабораторий, являющихся базой для научно-исследовательских работ преподавателей кафедры биохимии и сотрудников института:

Лаборатория нейрохимии и обмена веществ
Заведующая: д.б.н. Наталья Дмитриевна Ещенко

Лаборатория химии белка
Заведующий: д.б.н. Владимир Николаевич Кокряков

Лаборатория энзимологии
Заведующий: д.б.н. Владислав Борисович Матюшичев

Лаборатория общей биохимии
Заведующий: 

Лаборатория внутриклеточной сигнализации
Заведующая: к.б.н. Галина Петровна Диже

Группа молекулярного моделирования
Руководитель: к.б.н. Василий Евгеньевич Стефанов